Будучи дефосфорилизована по 14-му остатку фосфосерина каждого из протомеров (это происходит при участии протеипфосфатазы), тетрамерная молекула фосфорилазы а распадается на две равные части (т. е, на два димера), называемые фосфорилазой b, и частично теряет каталитическую активность. После фосфорилирования протомеров в неполностью активных димерах фосфорилазы b тетрамерная структура восстанавливается и снова идет реакция фосфоролиза. Фосфорилирование димеров осуществляется при участии киназы фосфорилазы b, переносящей фосфат с АТФ на радикал остатка серина, находящийся в 14-м положении в полипептидной цепи мономера. Становление тетрамера зависит от присутствия Mg2 + , участвующего в образовании ионных связей между протомерами, в том числе, вероятно, за счет фосфатных групп.